top
論文投稿
病人的安全就是醫院的基石 感染管制是病人安全的基石
以次世代定序(NGS)方法檢測HIV-HCV病人之HCV基因亞型
投稿分類 其他
主委發表種類: 壁報
投稿標題(中): 以次世代定序(NGS)方法檢測HIV-HCV病人之HCV基因亞型
投稿標題(英): Hepatitis C Virus Genotyping using Next-Generation Sequencing in HIV-HCV coinfection patients
投稿摘要: 目的: 以Sanger直接定序法並做親緣分析是HCV基因分型的gold standard,惟其操作程序複雜又耗時,且若同時感染兩種基因型 (mixed type),Sanger定序法無法檢測出。自動化NGS檢測平台提供高可信度的HCV基因分型,mixed type的感染也可正確被檢測出,因此透過NGS方法,可提供醫師最正確的病毒資訊,讓病人得到適當治療。 方法: 篩選出HCV病毒量>1000 IU/ml的病人,分別以Sanger直接定序法及Santosa® SQ HCV Genotyping NGS Assay方法做定序,當結果不一致,再以Roche HCV GT做第三種方法檢測。 結果: 檢測30位病人,有15位病人結果一致。其餘15位病人,13位基因型相同,但亞型不同(minor discordance),這13位病人有4位以Sanger法只測得一種基因型別,但以NGS法發現病人是mixed type,其餘9位則都是基因型6,但兩種方法測得亞型不同。另有2位病人兩種方法結果不一致,再以Roche HCV GT試劑檢測,結果一位與Sanger法相同,另一位則與NGS檢測結果相同。 討論: 30位病人若排除minor discordance,NGS檢測結果與Sanger定序法有93.3%的一致性,且NGS檢測到4位病人有mixed type情形。另外有兩位病人兩種方式檢測出的基因型不同,以Roche HCV GT檢測後,有一位病人結果與NGS相同,但另一位病人則與Sanger定序結果相同。 結論: 以NGS方法做HCV基因分型確實可以快速提供臨床醫師正確HCV型別及變異分析,將是未來基因分型的主要方法。
稿件檔:
加入會員 | 忘記密碼
1.正式會員:帳號為您的身分證字號,原始密碼為身分證字號後五碼加出生月日四碼。
2.感管之友:帳號為您的身分證字號,密碼為您當初所設定的密碼。
3.感管之友轉正式會員沿用原密碼。
帳號
密碼
1.感管之友:帳號為您的身分證字號,密碼為您當初所設定的密碼。 2.正式會員:帳號為您的身分證字號,原始密碼為身分證字號後五碼加出生月日四碼。