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分析中部某醫學中心利用多標的核酸檢測平台診斷 未知肺炎之病原分布情形

微生物

壁報

分析中部某醫學中心利用多標的核酸檢測平台診斷 未知肺炎之病原分布情形

Analysis the distribution of the pathogen of unknown pneumonia using a multi-label nucleic acid detection platform in a medical center in central Taiwan

前言
2019年12月起中國湖北武漢市發現不明原因肺炎群聚,台灣於2020年1月15日起公告「嚴重特殊傳染性肺炎」(COVID-19)為第五類法定傳染病,因應 COVID-19嚴重特殊傳染性肺炎防疫緊急處理流程且立即進行排除不明原因肺炎的項目檢驗,新增分子生物學快速偵測多重病原體核酸分析鑑定系統。
方法
本研究採回溯性觀察研究法(Retrospective study),分析2020年1月至2020年10月期間有操作多重病原體核酸檢驗,測試方法為利用BioFire FilmArray儀器,使用呼吸道試劑套組(Respiratory Panel 2.0 ),對單個鼻咽拭子樣本中的多種呼吸道病原體進行核酸分離、擴增及檢測,分析檢測結果之病原分布情形及比較FilmArray RP 2.0 Panel呈陽性結果時之病毒培養檢驗結果。
結果
2020年1月至10月期間共送檢449件,有檢測到病原菌存在為197件(43.88%),未檢測到病原菌為252件(56.12%)。依陽性病原種類分析前三名,依序為人類鼻病毒/腸病毒(Human Rhinovirus/Enterovirus)檢出率最高,共計107件( 23.83%),第二為呼吸道融合病毒(Respiratory syncytial virus)有47件(10.47%),第三為腺病毒(Adenovirus),有36件(8.02%)。所有陽性族群中較為特殊為有發現47件同時存在二種以上病原菌共同感染(Co-infection)之情形,佔總檢體的比例為10.46%,分析此47件共同感染,可發現包含人類鼻病毒/腸病毒(Human Rhinovirus/Enterovirus)有35件(74.46%)。另分析使用呼吸道FilmArray檢測結果為陽性且同時檢驗病毒培養之分析結果,共有38件為兩種方法同時檢測,其中10件有一致之結果(26.31%),檢測之病原菌分別為Adenovirus 6件、Respiratory syncytial virus 1件、Parainfluenza 1件及Human Rhinovirus/Enterovirus 2件,其中有3件為病毒培養法只培養出一種病原菌但FilmArray檢測出為Co-infection,而有28件為FilmArray有檢測到但病毒培養為陰性(73.68%)。
討論
依據統計結果來看利用呼吸道BioFire FilmArray系統檢測出病原菌的比例有43.88%,接近五成左右,Co-infection的比例有10.46%,47個Co-infection個案中有32名皆為兒童,且為住院病人,其中有一筆更來自小兒加護病房,由上述分析可看出共同感染(Co-infection)以兒童佔較高比例,推測為小孩抵抗力較差之緣故,以上數據可提供臨床醫師參考。多標的核酸檢測Film Array只需大約1個小時就能有結果,反之如果依照傳統的病毒培養約需14天,耗時較長,從FilmArray檢測有病原菌存在且同時有操作病毒培養的統計結果來看,FilmArray有檢測到病原菌但病毒培養為陰性比例有73.68%,由此可見利用FilmArray檢測呼吸道病原體除了檢驗快速外可以更精準且同時檢測出是否有共同感染(Co-infection)。

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