投稿分類 感控監測

主委發表種類: 壁報

投稿標題(中): 某醫學中心 Elizabethkingia spp. 感染之調查及基因分析

投稿標題(英): Investigation and genetic analysis of Elizabethkingia spp. Infection in a medical center

投稿摘要: 前言：Elizabethkingia spp. 廣泛存在於院內的環境中，隨著 Elizabethkingia spp. 感染個案報導的增加，再加上 Elizabethkingia spp. 的多重抗藥性及被感染後病人的高死亡率，使得 Elizabethkingia spp. 造成之感染成為越來越重要的議題，本實驗針對 Elizabethkingia spp. 展開一系列的調查及基因分析。
方法：1.臨床鑑定：目前臨床較常使用的鑑定為Vitek2系統或是MALDI-TOF系統的Vitek MS (bioMérieux)、Bruker MALDI Biotyper (BD)等儀器。2.脈衝式電泳電泳（Pulsed Field electrophoresis）：以脈衝式膠體電泳技術 (Pulsed-field gel electrophoresis, PFGE) 分析菌株間之基因型，用H9812菌株作為分子量標記，H9812菌株使用XbaI 限制酶切割，Elizabethkingia spp. 使用XhoI 限制酶切割，再使用CHEF-DR III系統（Bio-Rad，USA）進行Pulsed Field electrophoresis，電泳條件恆溫槽溫度為14℃、變換時間(pulse ramp) 為1至25 秒、速度6 V/cm、電泳時間19小時。拍照紀錄電泳膠上的結果，並儲存成圖檔。使用BioNumerics 軟件（BioNumerics，Applied Maths NV，Belgium）進行PFGE 數據分析。3.定序系統iSeq100 sequencer (Illumina)，用DNAease UltraClean微生物試劑盒（Qiagen）製備基因組DNA，做基因定序分析。
討論：在某醫學中心發現疑似群突發事件，因此我們收集了醫院病人及環境的Elizabethkingia spp.的分離株，由於在鑑定上確定種名不易，常造成收案上的困擾，利用全基因組定序（Whole genome sequencing, WGS），導入MALDI-TOF 更新資料庫重新鑑定；接著設計多重PCR篩選群突發特異分子標記基因（GR3，GR4，GR5），希望能更快速的掌握醫院疑似群突發菌株。本次環境採檢在水龍頭的起泡頭及病人週遭環境，都發現了 Elizabethkingia spp. 以脈衝式電泳（Pulsed Field electrophoresis）證明大多數分離株可能是源自同型的菌株，所以證實 Elizabethkingia spp. 可能在醫療院所中傳播。定序基因圖譜，修正MALDI-TOF資料庫後重新鑑定的結果，發現之前鑑定為伊莉莎白菌其實有85.1% （161/295）是瘧蚊伊莉莎白菌（Elizabethkingia anophelis）。利用群突發株三個特異性基因體區段（GR3、GR4、GR5）設計的引子進行多重PCR篩選，能快速偵測伊莉莎白菌群突發株。
結論：一直以來用傳統鑑定方法鑑定為 Elizabethkingia spp.實際上很可能為Elizabethkingia anophelis ，根據其獨特的遺傳模式可提早鑑定出容易造成群突發之菌株，在發現區預先做好隔離措施，以免造成大規模的感染。Elizabethkingia spp. 在院內的傳播以接觸傳染為主，特別是在加護病房的水源及環境，在感染管制方面，加強環境清潔消毒、洗手及落實接觸隔離，才能有效控制 Elizabethkingia spp.在醫院的散佈。

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